Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SCARF1Q14162 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SCARF1Q14162 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCARF1Q14162 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCARF1Q14162 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
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