Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CNGB1Q14028 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CNGB1Q14028 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CNGB1Q14028 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CNGB1Q14028 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CNGB1Q14028 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
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