Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39BQ13838 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39BQ13838 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39BQ13838 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39BQ13838 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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