Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL4BQ13620 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUL4BQ13620 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CUL4BQ13620 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4BQ13620 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
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