Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF4BQ13523 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRPF4BQ13523 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF4BQ13523 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF4BQ13523 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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