Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 LSM5YER146W 282 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 URE2YNL229C 1065 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 YNR068CYNR068C 819 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 GUT1YHL032C 2130 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 AFG2YLR397C 2343 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 STF1YDL130W-A 261 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 HBS1YKR084C 1836 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 YEL008WYEL008W 381 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 CWP2YKL096W-A 279 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 YNL165WYNL165W 1221 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 LSR1LSR1 1175 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 TAT2YOL020W 1779 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 YIL108WYIL108W 2091 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 DDI1YER143W 1287 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 AIM1YAL046C 357 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 TMA23YMR269W 636 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 POP2YNR052C 1302 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 AGP3YFL055W 1677 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 ENT4YLL038C 744 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 AST1YBL069W 1290 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 CCT5YJR064W 1689 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 TIM44YIL022W 1296 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 YJL107CYJL107C 1164 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 HOS2YGL194C 1359 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 STE4YOR212W 1272 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 DLD3YEL071W 1491 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 YDR455CYDR455C 309 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 YLR046CYLR046C 813 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 RPD3YNL330C 1302 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 IMO32YGR031W 1029 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 AIM34YMR003W 597 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 ERG13YML126C 1476 nt8.47□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 TOP3YLR234W 1971 nt8.46□□□□□ -1.05
YLL054CQ12244 RRT8YOL048C 1029 nt8.46□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YCR099CYCR099C 468 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 PIC2YER053C 903 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 SNZ1YMR096W 894 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YMR262WYMR262W 942 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YPR126CYPR126C 309 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 MSB3YNL293W 1902 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 TAF13YML098W 504 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 MOD5YOR274W 1287 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 IML3YBR107C 738 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 MET1YKR069W 1782 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 ADE8YDR408C 645 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YEL074WYEL074W 339 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YLR349WYLR349W 507 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 NAT5YOR253W 531 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 ITR2YOL103W 1830 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YGL118CYGL118C 438 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 CPD1YGR247W 720 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 LSM12YHR121W 564 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YMR147WYMR147W 672 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 SCO2YBR024W 906 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 HXT13YEL069C 1695 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 RSM23YGL129C 1353 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 YJR114WYJR114W 393 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL054CQ12244 ADE16YLR028C 1776 nt8.4□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 CTI6YPL181W 1521 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 APM1YPL259C 1428 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 YJL045WYJL045W 1905 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 EEB1YPL095C 1371 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 MHF1YOL086W-A 273 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 RIM2YBR192W 1134 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 ITR1YDR497C 1755 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 ADH7YCR105W 1086 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 RPC31YNL151C 756 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 FET5YFL041W 1869 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 CHA1YCL064C 1083 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 YHP1YDR451C 1062 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 AIM41YOR215C 558 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 BAP3YDR046C 1815 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 DPL1YDR294C 1770 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 YNL040WYNL040W 1371 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 PFS2YNL317W 1398 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 SPS100YHR139C 981 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 VMA11YPL234C 495 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 CMK2YOL016C 1344 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 LEU4YNL104C 1860 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 ICE2YIL090W 1476 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 ATO2YNR002C 849 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 TIP1YBR067C 633 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 SAC7YDR389W 1965 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 POT1YIL160C 1254 nt8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.1 ms