Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 OYE3YPL171C 1203 nt11.19□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 TAZ1YPR140W 1146 nt11.19□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 CTI6YPL181W 1521 nt11.19□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YDL158CYDL158C 309 nt11.18□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YER147C-AYER147C-A 411 nt11.18□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YPR150WYPR150W 522 nt11.18□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 FUB1YCR076C 753 nt11.17□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 APS2YJR058C 444 nt11.17□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 URA6YKL024C 615 nt11.17□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 PEX12YMR026C 1200 nt11.17□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 ACO2YJL200C 2370 nt11.17□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YER188WYER188W 720 nt11.16□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 DAK2YFL053W 1776 nt11.16□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.15□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YGR011WYGR011W 327 nt11.15□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YLR283WYLR283W 945 nt11.15□□□□□ -0.62
NOP53Q12080 YHR054CYHR054C 1065 nt11.14□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 RSA3YLR221C 663 nt11.14□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 IML3YBR107C 738 nt11.14□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 URA8YJR103W 1737 nt11.13□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 EAF3YPR023C 1206 nt11.13□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 PZF1YPR186C 1290 nt11.13□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 PET8YNL003C 855 nt11.12□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 NIF3YGL221C 867 nt11.11□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 RIB1YBL033C 1038 nt11.11□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 YNL319WYNL319W 441 nt11.11□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 RSC4YKR008W 1878 nt11.1□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 DLD2YDL178W 1593 nt11.09□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 MAF1YDR005C 1188 nt11.09□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 YNL024CYNL024C 741 nt11.09□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 CWC25YNL245C 540 nt11.09□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 snR34snR34 203 nt11.09□□□□□ -0.63
NOP53Q12080 MUP1YGR055W 1725 nt11.08□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 RAI1YGL246C 1164 nt11.07□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 ERG6YML008C 1152 nt11.07□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 TMA23YMR269W 636 nt11.07□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 FLR1YBR008C 1647 nt11.06□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 ZRT3YKL175W 1512 nt11.06□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 YLR460CYLR460C 1131 nt11.06□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 RMA1YKL132C 1293 nt11.05□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 DSE3YOR264W 1293 nt11.05□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 PRM4YPL156C 855 nt11.05□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 SLX1YBR228W 915 nt11.05□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 SOD2YHR008C 702 nt11.04□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 MIX17YMR002W 471 nt11.04□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 YOL107WYOL107W 1029 nt11.04□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 RPC82YPR190C 1965 nt11.04□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 DDI1YER143W 1287 nt11.03□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 YIA6YIL006W 1122 nt11.03□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 YNL303WYNL303W 348 nt11.03□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 PRE2YPR103W 864 nt11.03□□□□□ -0.64
NOP53Q12080 OSW1YOR255W 837 nt11.02□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 ESBP6YNL125C 2022 nt11.01□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 IGD1YFR017C 588 nt11.01□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 OSH7YHR001W 1314 nt11.01□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 ALG7YBR243C 1347 nt11.01□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 LSM5YER146W 282 nt10.99□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 ECM9YKR004C 1134 nt10.99□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 LIP2YLR239C 987 nt10.99□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 INA1YLR413W 2028 nt10.99□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 RSC8YFR037C 1674 nt10.98□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 SOL2YCR073W-A 948 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 IMO32YGR031W 1029 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 MSA2YKR077W 1092 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 NMD4YLR363C 657 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 CSI1YMR025W 888 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 YPS3YLR121C 1527 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 FMS1YMR020W 1527 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP53Q12080 SVF1YDR346C 1446 nt10.95□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YCP4YCR004C 744 nt10.95□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 SPS100YHR139C 981 nt10.95□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 ILV2YMR108W 2064 nt10.94□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 HEM13YDR044W 987 nt10.94□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YJL067WYJL067W 351 nt10.94□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 RER1YCL001W 567 nt10.94□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 SAM50YNL026W 1455 nt10.93□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.93□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 GTB1YDR221W 2109 nt10.93□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YCR049CYCR049C 447 nt10.92□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YGR283CYGR283C 1026 nt10.92□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 PEX22YAL055W 543 nt10.92□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 SUT2YPR009W 807 nt10.92□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 SPP2YOR148C 558 nt10.91□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YIL092WYIL092W 1902 nt10.9□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YLR169WYLR169W 354 nt10.9□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 CDD1YLR245C 429 nt10.9□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 IPL1YPL209C 1104 nt10.9□□□□□ -0.66
NOP53Q12080 YCR025CYCR025C 411 nt10.89□□□□□ -0.67
NOP53Q12080 YDR455CYDR455C 309 nt10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.6 ms