Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAAP100Q0VG06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAAP100Q0VG06 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAAP100Q0VG06 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAAP100Q0VG06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FAAP100Q0VG06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAAP100Q0VG06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAAP100Q0VG06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAAP100Q0VG06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAAP100Q0VG06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms