Protein–RNA interactions for Protein: Q08702

HNT3, Aprataxin-like protein, yeastyeast

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HNT3Q08702 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 FLX1YIL134W 936 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 RPC31YNL151C 756 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 NME1NME1 340 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 ZAP1YJL056C 2643 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 SFL1YOR140W 2301 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 URA8YJR103W 1737 nt7.52□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 ADH3YMR083W 1128 nt7.51□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 CYT1YOR065W 930 nt7.5□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 ODC1YPL134C 933 nt7.5□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 SSL2YIL143C 2532 nt7.49□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 SBP1YHL034C 885 nt7.49□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 SLG1YOR008C 1137 nt7.49□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 SDS24YBR214W 1584 nt7.49□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 PHB2YGR231C 933 nt7.48□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 RSM7YJR113C 744 nt7.48□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 MDM35YKL053C-A 261 nt7.48□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 YCP4YCR004C 744 nt7.47□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 KGD2YDR148C 1392 nt7.46□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 YMR209CYMR209C 1374 nt7.46□□□□□ -1.21
HNT3Q08702 LYS20YDL182W 1287 nt7.46□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 DMA2YNL116W 1569 nt7.46□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 GAS1YMR307W 1680 nt7.45□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 INH1YDL181W 258 nt7.45□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 CDD1YLR245C 429 nt7.45□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 RIM2YBR192W 1134 nt7.45□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 SAN1YDR143C 1833 nt7.45□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 SRP102YKL154W 735 nt7.44□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YLR280CYLR280C 351 nt7.44□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 PTC6YCR079W 1329 nt7.44□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 FRA1YLL029W 2250 nt7.44□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 VBA3YCL069W 1377 nt7.44□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 RCR1YBR005W 642 nt7.43□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 SAM50YNL026W 1455 nt7.43□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 HTS1YPR033C 1641 nt7.42□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YDR467CYDR467C 327 nt7.42□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 SER2YGR208W 930 nt7.42□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 GGA2YHR108W 1758 nt7.41□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YLR460CYLR460C 1131 nt7.41□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YIL177CYIL177C 5277 nt7.41□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YIA6YIL006W 1122 nt7.4□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YMR007WYMR007W 381 nt7.4□□□□□ -1.22
HNT3Q08702 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.4□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.4□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.4□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 ERO1YML130C 1692 nt7.39□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 YFR020WYFR020W 699 nt7.39□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 DPL1YDR294C 1770 nt7.38□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 PSD1YNL169C 1503 nt7.38□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 YGR210CYGR210C 1236 nt7.37□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 GPM1YKL152C 744 nt7.37□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 YMC2YBR104W 990 nt7.37□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 MAE1YKL029C 2010 nt7.36□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 RIB1YBL033C 1038 nt7.36□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 LEU4YNL104C 1860 nt7.36□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 FCY1YPR062W 477 nt7.35□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 GNP1YDR508C 1992 nt7.35□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 SOD2YHR008C 702 nt7.34□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 YBL095WYBL095W 813 nt7.34□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 OLA1YBR025C 1185 nt7.34□□□□□ -1.23
HNT3Q08702 CHS7YHR142W 951 nt7.33□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 YIR035CYIR035C 765 nt7.33□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 MRS4YKR052C 915 nt7.31□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 HXT10YFL011W 1641 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 THI3YDL080C 1830 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.3□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 SWM1YDR260C 513 nt7.28□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 YJL009WYJL009W 327 nt7.28□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 YPL108WYPL108W 507 nt7.28□□□□□ -1.24
HNT3Q08702 YMR166CYMR166C 1107 nt7.27□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 NSG2YNL156C 900 nt7.27□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 LSP1YPL004C 1026 nt7.27□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.26□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.26□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 TMS1YDR105C 1422 nt7.26□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 AGP3YFL055W 1677 nt7.25□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 YHR218WYHR218W 1812 nt7.25□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 RRT14YIL127C 621 nt7.25□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 YJR149WYJR149W 1215 nt7.25□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 YDR306CYDR306C 1437 nt7.25□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 ERG6YML008C 1152 nt7.24□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 AAC3YBR085W 924 nt7.24□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 TPN1YGL186C 1740 nt7.24□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 YPT31YER031C 672 nt7.23□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 BUB2YMR055C 921 nt7.23□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 NPP2YEL016C 1482 nt7.23□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 MET22YOL064C 1074 nt7.22□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 YLR173WYLR173W 1827 nt7.22□□□□□ -1.25
HNT3Q08702 CAK1YFL029C 1107 nt7.21□□□□□ -1.26
HNT3Q08702 AAT1YKL106W 1356 nt7.2□□□□□ -1.26
HNT3Q08702 OCH1YGL038C 1443 nt7.2□□□□□ -1.26
HNT3Q08702 YMR206WYMR206W 942 nt7.2□□□□□ -1.26
HNT3Q08702 YPR084WYPR084W 1371 nt7.2□□□□□ -1.26
HNT3Q08702 MFT1YML062C 1179 nt7.19□□□□□ -1.26
HNT3Q08702 PDC6YGR087C 1692 nt7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.4 ms