Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL1Q08397 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXL1Q08397 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL1Q08397 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms