Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
GOLGA3Q08378 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
GOLGA3Q08378 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
GOLGA3Q08378 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
GOLGA3Q08378 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
GOLGA3Q08378 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
GOLGA3Q08378 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms