Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC3A1Q07837 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC3A1Q07837 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A1Q07837 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms