Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TFF3Q07654 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFF3Q07654 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFF3Q07654 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFF3Q07654 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms