Protein–RNA interactions for Protein: Q07617

SPAG1, Sperm-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG1Q07617 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPAG1Q07617 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG1Q07617 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG1Q07617 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SPAG1Q07617 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPAG1Q07617 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPAG1Q07617 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms