Protein–RNA interactions for Protein: Q07500

NDE2, External NADH-ubiquinone oxidoreductase 2, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDE2Q07500 YIL177CYIL177C 5277 nt7.2□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 TMA23YMR269W 636 nt7.2□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 AIM1YAL046C 357 nt7.19□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 LSR1LSR1 1175 nt7.19□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ATO2YNR002C 849 nt7.19□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 YCR061WYCR061W 1896 nt7.19□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 CCT5YJR064W 1689 nt7.19□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 YDR455CYDR455C 309 nt7.18□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 CWP2YKL096W-A 279 nt7.18□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ORT1YOR130C 879 nt7.18□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 MAS2YHR024C 1449 nt7.18□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 CHA1YCL064C 1083 nt7.17□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 FET5YFL041W 1869 nt7.17□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 CKI1YLR133W 1749 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 LSM5YER146W 282 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 IMO32YGR031W 1029 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 YPR126CYPR126C 309 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 YER152CYER152C 1332 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 DLD3YEL071W 1491 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 PRC1YMR297W 1599 nt7.16□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 STE4YOR212W 1272 nt7.15□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 snR4snR4 186 nt7.15□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 DDI1YER143W 1287 nt7.14□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 HSV2YGR223C 1347 nt7.14□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 YLR046CYLR046C 813 nt7.14□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 FCP1YMR277W 2199 nt7.13□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 ERG13YML126C 1476 nt7.13□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 SLM3YDL033C 1254 nt7.13□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 SMC5YOL034W 3282 nt7.13□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 YHR219WYHR219W 1875 nt7.13□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 SAC7YDR389W 1965 nt7.12□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 TIM44YIL022W 1296 nt7.12□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 YLR349WYLR349W 507 nt7.12□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 YJR154WYJR154W 1041 nt7.11□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 SNZ1YMR096W 894 nt7.1□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 VMA11YPL234C 495 nt7.1□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 ERR3YMR323W 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 ERR1YOR393W 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 ERR2YPL281C 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
NDE2Q07500 KRR1YCL059C 951 nt7.07□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 MHF1YOL086W-A 273 nt7.07□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 IML3YBR107C 738 nt7.07□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 ITR2YOL103W 1830 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 RPD3YNL330C 1302 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 CRN1YLR429W 1956 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 AQR1YNL065W 1761 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 YLR072WYLR072W 2082 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 ADE8YDR408C 645 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 CPD1YGR247W 720 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 YJR114WYJR114W 393 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 YMR253CYMR253C 1245 nt7.06□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 ERG6YML008C 1152 nt7.05□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 TAF13YML098W 504 nt7.05□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 YNR064CYNR064C 873 nt7.05□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 TVP23YDR084C 600 nt7.04□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 YMR262WYMR262W 942 nt7.04□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 SPS100YHR139C 981 nt7.03□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 OPI3YJR073C 621 nt7.03□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 MET8YBR213W 825 nt7.03□□□□□ -1.28
NDE2Q07500 SPE4YLR146C 903 nt7.02□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 Q0010Q0010 387 nt7.02□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 YMR265CYMR265C 1386 nt7.02□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 CTI6YPL181W 1521 nt7.01□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.01□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 TIP1YBR067C 633 nt7.01□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 YBL111CYBL111C 2004 nt7.01□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 RAD51YER095W 1203 nt7□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 POT1YIL160C 1254 nt7□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 MDH2YOL126C 1134 nt7□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 TOS2YGR221C 1869 nt7□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 ACO1YLR304C 2337 nt6.99□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 INH1YDL181W 258 nt6.99□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 EDC3YEL015W 1656 nt6.99□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 KEL3YPL263C 1956 nt6.99□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 ADH7YCR105W 1086 nt6.98□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 GSF2YML048W 1212 nt6.98□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 RPC31YNL151C 756 nt6.98□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 HAP5YOR358W 729 nt6.98□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 HSM3YBR272C 1443 nt6.98□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 DIA4YHR011W 1341 nt6.98□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 RPN14YGL004C 1254 nt6.97□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 SNX3YOR357C 489 nt6.97□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 RIM2YBR192W 1134 nt6.97□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 SUV3YPL029W 2214 nt6.97□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 SAM50YNL026W 1455 nt6.97□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 NMD5YJR132W 3147 nt6.96□□□□□ -1.29
NDE2Q07500 ADE17YMR120C 1779 nt6.96□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 SWT21YNL187W 1074 nt6.96□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 PAU15YIR041W 375 nt6.95□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 ELO1YJL196C 933 nt6.95□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 ABZ2YMR289W 1125 nt6.95□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 ICL2YPR006C 1728 nt6.95□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 TUB4YLR212C 1422 nt6.94□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 snR31snR31 225 nt6.94□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 PRP2YNR011C 2631 nt6.93□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 STP3YLR375W 1032 nt6.93□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 POB3YML069W 1659 nt6.93□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 HXT11YOL156W 1704 nt6.93□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 DPL1YDR294C 1770 nt6.92□□□□□ -1.3
NDE2Q07500 PMT7YDR307W 1989 nt6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms