Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD51Q06609 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD51Q06609 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51Q06609 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms