Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
APLP2Q06481 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
APLP2Q06481 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
APLP2Q06481 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
APLP2Q06481 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.72■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
APLP2Q06481 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
APLP2Q06481 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
APLP2Q06481 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
APLP2Q06481 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
APLP2Q06481 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.43■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
APLP2Q06481 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.38■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
APLP2Q06481 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms