Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 YHR219WYHR219W 1875 nt10.44□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 LSR1LSR1 1175 nt10.44□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 YKL133CYKL133C 1392 nt10.43□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 CRC1YOR100C 984 nt10.43□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 FCY1YPR062W 477 nt10.43□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 HOL1YNR055C 1761 nt10.43□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 MRS6YOR370C 1812 nt10.42□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 SGA1YIL099W 1650 nt10.41□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 SNX3YOR357C 489 nt10.4□□□□□ -0.74
NSE3Q05541 BUD20YLR074C 501 nt10.38□□□□□ -0.75
NSE3Q05541 RPD3YNL330C 1302 nt10.37□□□□□ -0.75
NSE3Q05541 SAN1YDR143C 1833 nt10.36□□□□□ -0.75
NSE3Q05541 YPT11YNL304W 1254 nt10.36□□□□□ -0.75
NSE3Q05541 YFR020WYFR020W 699 nt10.34□□□□□ -0.75
NSE3Q05541 YPL108WYPL108W 507 nt10.33□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 KGD2YDR148C 1392 nt10.33□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 ZAP1YJL056C 2643 nt10.3□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 HIS2YFR025C 1008 nt10.3□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 RIM2YBR192W 1134 nt10.3□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 RSM7YJR113C 744 nt10.28□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 GAS1YMR307W 1680 nt10.28□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 MAS1YLR163C 1389 nt10.27□□□□□ -0.76
NSE3Q05541 PTC6YCR079W 1329 nt10.27□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 MCM5YLR274W 2328 nt10.27□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 RSC4YKR008W 1878 nt10.26□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 SBP1YHL034C 885 nt10.26□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 EMC3YKL207W 762 nt10.26□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 PAU21YOR394W 495 nt10.26□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 PAU22YPL282C 495 nt10.26□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 UGP1YKL035W 1500 nt10.25□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 GRH1YDR517W 1119 nt10.25□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 YJL160CYJL160C 864 nt10.25□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 YOR343CYOR343C 327 nt10.25□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 KRR1YCL059C 951 nt10.24□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 HRA1HRA1 564 nt10.23□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 LSP1YPL004C 1026 nt10.23□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 CWP2YKL096W-A 279 nt10.22□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 YMR210WYMR210W 1350 nt10.22□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 GID7YCL039W 2238 nt10.22□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 YMR166CYMR166C 1107 nt10.21□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 RPC31YNL151C 756 nt10.21□□□□□ -0.77
NSE3Q05541 PAB1YER165W 1734 nt10.2□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 SSL2YIL143C 2532 nt10.19□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 YGR139WYGR139W 339 nt10.18□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 YLR460CYLR460C 1131 nt10.18□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.17□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 ESBP6YNL125C 2022 nt10.17□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 RPL12BYDR418W 498 nt10.16□□□□□ -0.78
NSE3Q05541 MRP1YDR347W 966 nt10.14□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 PET18YCR020C 648 nt10.13□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 RRT14YIL127C 621 nt10.13□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 ODC1YPL134C 933 nt10.13□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 CAK1YFL029C 1107 nt10.12□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 DPL1YDR294C 1770 nt10.11□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 GGA2YHR108W 1758 nt10.11□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 CHS7YHR142W 951 nt10.1□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 MFT1YML062C 1179 nt10.1□□□□□ -0.79
NSE3Q05541 OCH1YGL038C 1443 nt10.08□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 MET22YOL064C 1074 nt10.08□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 GDH1YOR375C 1365 nt10.07□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.07□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 OLA1YBR025C 1185 nt10.07□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 THI3YDL080C 1830 nt10.07□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 UTR5YEL035C 501 nt10.06□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 HEM14YER014W 1620 nt10.05□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 ADA2YDR448W 1305 nt10.05□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 GPM1YKL152C 744 nt10.04□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 YDR467CYDR467C 327 nt10.03□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 YER156CYER156C 1017 nt10.03□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 MDM35YKL053C-A 261 nt10.03□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 YPR084WYPR084W 1371 nt10.02□□□□□ -0.8
NSE3Q05541 YDR306CYDR306C 1437 nt10.01□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 PDC6YGR087C 1692 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 SUP51tL(UAA)J 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 TAD2YJL035C 753 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 YJR149WYJR149W 1215 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 RPS6AYPL090C 711 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 RPS6BYBR181C 711 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 LEU4YNL104C 1860 nt10□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 YIR035CYIR035C 765 nt9.99□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 YOR268CYOR268C 399 nt9.99□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 BXI1YNL305C 894 nt9.98□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 RIM8YGL045W 1629 nt9.97□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 RNA170RNA170 169 nt9.97□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 YMR206WYMR206W 942 nt9.97□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 PUS7YOR243C 2031 nt9.96□□□□□ -0.81
NSE3Q05541 YPT31YER031C 672 nt9.96□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 ELP4YPL101W 1371 nt9.96□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 KAE1YKR038C 1161 nt9.95□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 DTR1YBR180W 1719 nt9.95□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 CSM2YIL132C 642 nt9.94□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 YGL114WYGL114W 2178 nt9.94□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 TMS1YDR105C 1422 nt9.93□□□□□ -0.82
NSE3Q05541 EDC2YER035W 438 nt9.93□□□□□ -0.82
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