Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD164Q04900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD164Q04900 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD164Q04900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD164Q04900 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD164Q04900 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD164Q04900 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD164Q04900 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD164Q04900 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD164Q04900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD164Q04900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD164Q04900 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD164Q04900 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD164Q04900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD164Q04900 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD164Q04900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD164Q04900 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD164Q04900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD164Q04900 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD164Q04900 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD164Q04900 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD164Q04900 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD164Q04900 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD164Q04900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD164Q04900 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD164Q04900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD164Q04900 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD164Q04900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD164Q04900 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD164Q04900 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD164Q04900 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD164Q04900 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD164Q04900 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CD164Q04900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD164Q04900 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD164Q04900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD164Q04900 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD164Q04900 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD164Q04900 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD164Q04900 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD164Q04900 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD164Q04900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms