Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRB3Q04118 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB3Q04118 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRB3Q04118 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRB3Q04118 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRB3Q04118 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRB3Q04118 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB3Q04118 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB3Q04118 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRB3Q04118 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB3Q04118 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB3Q04118 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB3Q04118 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB3Q04118 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB3Q04118 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB3Q04118 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB3Q04118 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB3Q04118 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB3Q04118 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB3Q04118 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB3Q04118 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRB3Q04118 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRB3Q04118 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRB3Q04118 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRB3Q04118 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRB3Q04118 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRB3Q04118 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRB3Q04118 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms