Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.98□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 GDH1YOR375C 1365 nt9.97□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 YAT1YAR035W 2064 nt9.97□□□□□ -0.81
SYF1Q04048 OPI10YOL032W 741 nt9.96□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 snR31snR31 225 nt9.96□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 ITR2YOL103W 1830 nt9.96□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 YMR206WYMR206W 942 nt9.95□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 TOS1YBR162C 1368 nt9.95□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 SUV3YPL029W 2214 nt9.94□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 PET18YCR020C 648 nt9.93□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 YMR166CYMR166C 1107 nt9.92□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 ILV3YJR016C 1758 nt9.92□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 YPT11YNL304W 1254 nt9.91□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 RPC82YPR190C 1965 nt9.91□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 ADA2YDR448W 1305 nt9.9□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 UTR5YEL035C 501 nt9.9□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 MFT1YML062C 1179 nt9.9□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 CRC1YOR100C 984 nt9.9□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 HAP5YOR358W 729 nt9.9□□□□□ -0.82
SYF1Q04048 DLD3YEL071W 1491 nt9.9□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 YMR265CYMR265C 1386 nt9.88□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 SDH8YBR269C 417 nt9.88□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 RPN14YGL004C 1254 nt9.87□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 SAN1YDR143C 1833 nt9.86□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 BAP3YDR046C 1815 nt9.85□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 TAD2YJL035C 753 nt9.85□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 RSM7YJR113C 744 nt9.85□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 YJR149WYJR149W 1215 nt9.84□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 PRE5YMR314W 705 nt9.84□□□□□ -0.83
SYF1Q04048 RRT14YIL127C 621 nt9.83□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 ELP4YPL101W 1371 nt9.82□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 CAK1YFL029C 1107 nt9.81□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 PTC6YCR079W 1329 nt9.81□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 VMA11YPL234C 495 nt9.8□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 YPL247CYPL247C 1572 nt9.8□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 SFP1YLR403W 2052 nt9.79□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 KGD2YDR148C 1392 nt9.79□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 GAS1YMR307W 1680 nt9.79□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 GID8YMR135C 1368 nt9.78□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 LSR1LSR1 1175 nt9.78□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 ARO8YGL202W 1503 nt9.77□□□□□ -0.84
SYF1Q04048 YER156CYER156C 1017 nt9.76□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 ADE1YAR015W 921 nt9.76□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 YLR460CYLR460C 1131 nt9.76□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 MUP1YGR055W 1725 nt9.76□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 YHR219WYHR219W 1875 nt9.75□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 PET494YNR045W 1470 nt9.75□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 YJL043WYJL043W 774 nt9.75□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 SNX3YOR357C 489 nt9.75□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 BSP1YPR171W 1731 nt9.74□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 OCH1YGL038C 1443 nt9.73□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 SBP1YHL034C 885 nt9.73□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 FUS3YBL016W 1062 nt9.73□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 RPS6AYPL090C 711 nt9.73□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 RPS6BYBR181C 711 nt9.73□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 YPR084WYPR084W 1371 nt9.73□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 YKL133CYKL133C 1392 nt9.72□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 MET2YNL277W 1461 nt9.72□□□□□ -0.85
SYF1Q04048 SPT20YOL148C 1815 nt9.7□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 BXI1YNL305C 894 nt9.7□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 MET22YOL064C 1074 nt9.7□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 KES1YPL145C 1305 nt9.7□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 MRS6YOR370C 1812 nt9.7□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 CHS7YHR142W 951 nt9.69□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 TDH1YJL052W 999 nt9.69□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 NPP1YCR026C 2229 nt9.68□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 RPD3YNL330C 1302 nt9.67□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 OLA1YBR025C 1185 nt9.66□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 MAE1YKL029C 2010 nt9.65□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 COQ8YGL119W 1506 nt9.65□□□□□ -0.86
SYF1Q04048 NUP53YMR153W 1428 nt9.65□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 HMG2YLR450W 3138 nt9.63□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 RIM8YGL045W 1629 nt9.63□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 PDC6YGR087C 1692 nt9.61□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 YPT31YER031C 672 nt9.61□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 ATP2YJR121W 1536 nt9.61□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 SGA1YIL099W 1650 nt9.61□□□□□ -0.87
SYF1Q04048 YGL114WYGL114W 2178 nt9.58□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 YIL168WYIL168W 384 nt9.58□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 COS10YNR075W 1125 nt9.57□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 RNA170RNA170 169 nt9.56□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 RPR1RPR1 369 nt9.56□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 TPO4YOR273C 1980 nt9.55□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 YDR476CYDR476C 675 nt9.54□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 HOL1YNR055C 1761 nt9.52□□□□□ -0.88
SYF1Q04048 RRT6YGL146C 936 nt9.52□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 GGA2YHR108W 1758 nt9.52□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 KRR1YCL059C 951 nt9.51□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 RPC31YNL151C 756 nt9.51□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 ZAP1YJL056C 2643 nt9.5□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 YLR358CYLR358C 564 nt9.5□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 RHO1YPR165W 630 nt9.5□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 YBL095WYBL095W 813 nt9.49□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 THI3YDL080C 1830 nt9.49□□□□□ -0.89
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