Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3Q03167 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR3Q03167 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR3Q03167 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms