Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHLH1Q02575 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHLH1Q02575 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHLH1Q02575 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHLH1Q02575 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHLH1Q02575 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHLH1Q02575 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHLH1Q02575 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NHLH1Q02575 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHLH1Q02575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms