Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC6A3Q01959 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC6A3Q01959 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC6A3Q01959 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A3Q01959 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC6A3Q01959 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms