Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
XPCQ01831 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
XPCQ01831 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
XPCQ01831 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XPCQ01831 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XPCQ01831 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XPCQ01831 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
XPCQ01831 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
XPCQ01831 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
XPCQ01831 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
XPCQ01831 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
XPCQ01831 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
XPCQ01831 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
XPCQ01831 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
XPCQ01831 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
XPCQ01831 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
XPCQ01831 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
XPCQ01831 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
XPCQ01831 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
XPCQ01831 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
XPCQ01831 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
XPCQ01831 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
XPCQ01831 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
XPCQ01831 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
XPCQ01831 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
XPCQ01831 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
XPCQ01831 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
XPCQ01831 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
XPCQ01831 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
XPCQ01831 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
XPCQ01831 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
XPCQ01831 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
XPCQ01831 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
XPCQ01831 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
XPCQ01831 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
XPCQ01831 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
XPCQ01831 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
XPCQ01831 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
XPCQ01831 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
XPCQ01831 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
XPCQ01831 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
XPCQ01831 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
XPCQ01831 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
XPCQ01831 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
XPCQ01831 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
XPCQ01831 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
XPCQ01831 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
XPCQ01831 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
XPCQ01831 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
XPCQ01831 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
XPCQ01831 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
XPCQ01831 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
XPCQ01831 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
XPCQ01831 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
XPCQ01831 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
XPCQ01831 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
XPCQ01831 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
XPCQ01831 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
XPCQ01831 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
XPCQ01831 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
XPCQ01831 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
XPCQ01831 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
XPCQ01831 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
XPCQ01831 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
XPCQ01831 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
XPCQ01831 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
XPCQ01831 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
XPCQ01831 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
XPCQ01831 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
XPCQ01831 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
XPCQ01831 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
XPCQ01831 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
XPCQ01831 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
XPCQ01831 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
XPCQ01831 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
XPCQ01831 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
XPCQ01831 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
XPCQ01831 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
XPCQ01831 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
XPCQ01831 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
XPCQ01831 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
XPCQ01831 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
XPCQ01831 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
XPCQ01831 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
XPCQ01831 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
XPCQ01831 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
XPCQ01831 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
XPCQ01831 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
XPCQ01831 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
XPCQ01831 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
XPCQ01831 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
XPCQ01831 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
XPCQ01831 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
XPCQ01831 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
XPCQ01831 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
XPCQ01831 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
XPCQ01831 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
XPCQ01831 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
XPCQ01831 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
XPCQ01831 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms