Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MC1RQ01726 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MC1RQ01726 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MC1RQ01726 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MC1RQ01726 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms