Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BEX3Q00994 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BEX3Q00994 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BEX3Q00994 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEX3Q00994 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEX3Q00994 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEX3Q00994 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEX3Q00994 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEX3Q00994 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BEX3Q00994 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BEX3Q00994 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEX3Q00994 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms