Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKD1P98161 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKD1P98161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKD1P98161 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKD1P98161 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKD1P98161 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKD1P98161 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKD1P98161 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKD1P98161 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKD1P98161 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKD1P98161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKD1P98161 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKD1P98161 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKD1P98161 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKD1P98161 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKD1P98161 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKD1P98161 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKD1P98161 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKD1P98161 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKD1P98161 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKD1P98161 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKD1P98161 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKD1P98161 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKD1P98161 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKD1P98161 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKD1P98161 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKD1P98161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKD1P98161 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKD1P98161 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKD1P98161 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKD1P98161 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKD1P98161 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKD1P98161 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKD1P98161 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKD1P98161 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PKD1P98161 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKD1P98161 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKD1P98161 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKD1P98161 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKD1P98161 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKD1P98161 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKD1P98161 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKD1P98161 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKD1P98161 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKD1P98161 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKD1P98161 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKD1P98161 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKD1P98161 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKD1P98161 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKD1P98161 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKD1P98161 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKD1P98161 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKD1P98161 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKD1P98161 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKD1P98161 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKD1P98161 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKD1P98161 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKD1P98161 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKD1P98161 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKD1P98161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKD1P98161 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKD1P98161 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKD1P98161 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKD1P98161 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKD1P98161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKD1P98161 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKD1P98161 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms