Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP2P81877 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSBP2P81877 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP2P81877 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms