Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTHL1P78549 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTHL1P78549 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTHL1P78549 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NTHL1P78549 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NTHL1P78549 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTHL1P78549 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTHL1P78549 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTHL1P78549 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTHL1P78549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTHL1P78549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms