Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUMO1P63165 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SUMO1P63165 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUMO1P63165 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms