Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMIM11AP58511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM11AP58511 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM11AP58511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms