Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSCP56915 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSCP56915 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GSCP56915 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GSCP56915 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSCP56915 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSCP56915 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSCP56915 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSCP56915 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GSCP56915 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSCP56915 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSCP56915 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSCP56915 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSCP56915 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSCP56915 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSCP56915 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSCP56915 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSCP56915 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSCP56915 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSCP56915 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSCP56915 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSCP56915 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSCP56915 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSCP56915 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSCP56915 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GSCP56915 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSCP56915 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSCP56915 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSCP56915 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GSCP56915 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSCP56915 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSCP56915 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSCP56915 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSCP56915 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSCP56915 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSCP56915 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSCP56915 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSCP56915 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GSCP56915 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GSCP56915 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSCP56915 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSCP56915 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GSCP56915 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSCP56915 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSCP56915 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSCP56915 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSCP56915 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSCP56915 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GSCP56915 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSCP56915 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSCP56915 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSCP56915 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSCP56915 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSCP56915 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSCP56915 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GSCP56915 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSCP56915 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSCP56915 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSCP56915 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSCP56915 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSCP56915 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSCP56915 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSCP56915 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSCP56915 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSCP56915 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSCP56915 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSCP56915 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSCP56915 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSCP56915 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GSCP56915 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GSCP56915 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSCP56915 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSCP56915 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSCP56915 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSCP56915 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GSCP56915 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSCP56915 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSCP56915 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSCP56915 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSCP56915 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSCP56915 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSCP56915 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSCP56915 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSCP56915 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSCP56915 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GSCP56915 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GSCP56915 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GSCP56915 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GSCP56915 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSCP56915 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSCP56915 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSCP56915 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSCP56915 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSCP56915 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSCP56915 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GSCP56915 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSCP56915 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSCP56915 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSCP56915 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GSCP56915 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms