Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATXN3P54252 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN3P54252 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN3P54252 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN3P54252 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms