Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFNA3P52797 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA3P52797 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA3P52797 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms