Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN2P51788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN2P51788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCN2P51788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms