Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR9P51686 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR9P51686 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR9P51686 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR9P51686 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR9P51686 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR9P51686 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR9P51686 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR9P51686 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR9P51686 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR9P51686 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR9P51686 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR9P51686 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR9P51686 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR9P51686 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR9P51686 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR9P51686 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR9P51686 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR9P51686 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR9P51686 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR9P51686 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR9P51686 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR9P51686 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR9P51686 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR9P51686 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR9P51686 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR9P51686 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR9P51686 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR9P51686 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR9P51686 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR9P51686 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR9P51686 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR9P51686 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR9P51686 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR9P51686 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR9P51686 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR9P51686 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR9P51686 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR9P51686 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR9P51686 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR9P51686 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR9P51686 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR9P51686 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR9P51686 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR9P51686 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR9P51686 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR9P51686 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR9P51686 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR9P51686 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR9P51686 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR9P51686 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR9P51686 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR9P51686 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR9P51686 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR9P51686 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR9P51686 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR9P51686 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR9P51686 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR9P51686 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR9P51686 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR9P51686 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR9P51686 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR9P51686 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR9P51686 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR9P51686 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR9P51686 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR9P51686 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCR9P51686 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCR9P51686 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms