Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DAP3P51398 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DAP3P51398 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DAP3P51398 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DAP3P51398 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DAP3P51398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DAP3P51398 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DAP3P51398 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DAP3P51398 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DAP3P51398 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DAP3P51398 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DAP3P51398 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DAP3P51398 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DAP3P51398 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DAP3P51398 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DAP3P51398 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DAP3P51398 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DAP3P51398 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DAP3P51398 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DAP3P51398 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DAP3P51398 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DAP3P51398 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DAP3P51398 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DAP3P51398 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DAP3P51398 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DAP3P51398 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DAP3P51398 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DAP3P51398 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DAP3P51398 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DAP3P51398 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DAP3P51398 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DAP3P51398 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DAP3P51398 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DAP3P51398 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DAP3P51398 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DAP3P51398 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DAP3P51398 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DAP3P51398 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DAP3P51398 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DAP3P51398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DAP3P51398 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DAP3P51398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DAP3P51398 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DAP3P51398 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DAP3P51398 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DAP3P51398 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DAP3P51398 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DAP3P51398 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DAP3P51398 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DAP3P51398 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DAP3P51398 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DAP3P51398 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DAP3P51398 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DAP3P51398 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DAP3P51398 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DAP3P51398 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DAP3P51398 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DAP3P51398 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DAP3P51398 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DAP3P51398 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DAP3P51398 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DAP3P51398 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DAP3P51398 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DAP3P51398 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DAP3P51398 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DAP3P51398 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DAP3P51398 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DAP3P51398 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DAP3P51398 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DAP3P51398 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DAP3P51398 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DAP3P51398 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DAP3P51398 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DAP3P51398 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DAP3P51398 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DAP3P51398 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DAP3P51398 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DAP3P51398 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DAP3P51398 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DAP3P51398 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms