Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK3P49761 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK3P49761 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK3P49761 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK3P49761 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK3P49761 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK3P49761 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK3P49761 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK3P49761 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK3P49761 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK3P49761 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK3P49761 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK3P49761 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK3P49761 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK3P49761 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK3P49761 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK3P49761 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK3P49761 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK3P49761 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK3P49761 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK3P49761 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK3P49761 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK3P49761 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK3P49761 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK3P49761 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK3P49761 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK3P49761 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK3P49761 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK3P49761 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK3P49761 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK3P49761 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK3P49761 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK3P49761 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK3P49761 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK3P49761 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK3P49761 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK3P49761 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK3P49761 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK3P49761 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK3P49761 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK3P49761 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK3P49761 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK3P49761 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK3P49761 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK3P49761 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK3P49761 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK3P49761 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK3P49761 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK3P49761 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK3P49761 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK3P49761 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK3P49761 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK3P49761 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK3P49761 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK3P49761 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK3P49761 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK3P49761 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK3P49761 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK3P49761 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK3P49761 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK3P49761 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK3P49761 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK3P49761 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK3P49761 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK3P49761 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK3P49761 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLK3P49761 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK3P49761 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK3P49761 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK3P49761 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK3P49761 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK3P49761 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK3P49761 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK3P49761 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK3P49761 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK3P49761 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK3P49761 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK3P49761 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK3P49761 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK3P49761 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK3P49761 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK3P49761 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK3P49761 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK3P49761 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK3P49761 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK3P49761 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms