Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POU3F4P49335 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU3F4P49335 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU3F4P49335 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU3F4P49335 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms