Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD97P48960 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD97P48960 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD97P48960 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD97P48960 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD97P48960 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD97P48960 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD97P48960 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD97P48960 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD97P48960 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD97P48960 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD97P48960 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD97P48960 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD97P48960 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD97P48960 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD97P48960 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD97P48960 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD97P48960 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD97P48960 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD97P48960 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD97P48960 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD97P48960 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD97P48960 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD97P48960 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD97P48960 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD97P48960 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD97P48960 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD97P48960 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD97P48960 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD97P48960 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD97P48960 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD97P48960 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD97P48960 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD97P48960 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD97P48960 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD97P48960 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD97P48960 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD97P48960 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD97P48960 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD97P48960 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD97P48960 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD97P48960 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD97P48960 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD97P48960 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD97P48960 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD97P48960 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD97P48960 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD97P48960 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD97P48960 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD97P48960 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD97P48960 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD97P48960 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD97P48960 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD97P48960 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD97P48960 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD97P48960 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD97P48960 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD97P48960 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD97P48960 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD97P48960 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD97P48960 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD97P48960 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD97P48960 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD97P48960 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD97P48960 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD97P48960 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD97P48960 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD97P48960 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD97P48960 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD97P48960 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD97P48960 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD97P48960 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD97P48960 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD97P48960 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD97P48960 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD97P48960 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD97P48960 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD97P48960 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD97P48960 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD97P48960 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD97P48960 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD97P48960 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD97P48960 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD97P48960 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD97P48960 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD97P48960 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD97P48960 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD97P48960 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD97P48960 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD97P48960 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms