Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARCN1P48444 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARCN1P48444 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCN1P48444 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms