Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PREPP48147 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREPP48147 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PREPP48147 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREPP48147 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREPP48147 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PREPP48147 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PREPP48147 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PREPP48147 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREPP48147 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREPP48147 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREPP48147 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREPP48147 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PREPP48147 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREPP48147 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PREPP48147 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREPP48147 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREPP48147 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREPP48147 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREPP48147 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREPP48147 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREPP48147 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PREPP48147 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREPP48147 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREPP48147 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREPP48147 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PREPP48147 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PREPP48147 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PREPP48147 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PREPP48147 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PREPP48147 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PREPP48147 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PREPP48147 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREPP48147 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREPP48147 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PREPP48147 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREPP48147 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREPP48147 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREPP48147 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREPP48147 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PREPP48147 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PREPP48147 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREPP48147 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREPP48147 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREPP48147 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREPP48147 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREPP48147 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREPP48147 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREPP48147 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREPP48147 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREPP48147 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREPP48147 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREPP48147 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PREPP48147 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREPP48147 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREPP48147 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREPP48147 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PREPP48147 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PREPP48147 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PREPP48147 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PREPP48147 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PREPP48147 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PREPP48147 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PREPP48147 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PREPP48147 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PREPP48147 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PREPP48147 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREPP48147 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREPP48147 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PREPP48147 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PREPP48147 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PREPP48147 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PREPP48147 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PREPP48147 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PREPP48147 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PREPP48147 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PREPP48147 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PREPP48147 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREPP48147 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREPP48147 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREPP48147 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREPP48147 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREPP48147 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREPP48147 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREPP48147 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREPP48147 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms