Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A9P48067 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A9P48067 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A9P48067 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms