Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XCR1P46094 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XCR1P46094 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XCR1P46094 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XCR1P46094 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XCR1P46094 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XCR1P46094 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XCR1P46094 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XCR1P46094 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XCR1P46094 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XCR1P46094 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XCR1P46094 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XCR1P46094 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XCR1P46094 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XCR1P46094 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XCR1P46094 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XCR1P46094 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XCR1P46094 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XCR1P46094 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XCR1P46094 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XCR1P46094 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XCR1P46094 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XCR1P46094 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XCR1P46094 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XCR1P46094 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XCR1P46094 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XCR1P46094 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XCR1P46094 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XCR1P46094 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XCR1P46094 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XCR1P46094 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XCR1P46094 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XCR1P46094 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XCR1P46094 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XCR1P46094 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XCR1P46094 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XCR1P46094 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XCR1P46094 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XCR1P46094 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XCR1P46094 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XCR1P46094 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XCR1P46094 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XCR1P46094 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XCR1P46094 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XCR1P46094 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XCR1P46094 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XCR1P46094 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XCR1P46094 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XCR1P46094 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XCR1P46094 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XCR1P46094 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XCR1P46094 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XCR1P46094 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XCR1P46094 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XCR1P46094 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XCR1P46094 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XCR1P46094 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XCR1P46094 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XCR1P46094 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XCR1P46094 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XCR1P46094 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XCR1P46094 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XCR1P46094 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XCR1P46094 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XCR1P46094 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XCR1P46094 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XCR1P46094 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XCR1P46094 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XCR1P46094 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XCR1P46094 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XCR1P46094 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XCR1P46094 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XCR1P46094 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XCR1P46094 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XCR1P46094 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XCR1P46094 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XCR1P46094 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XCR1P46094 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XCR1P46094 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XCR1P46094 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XCR1P46094 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XCR1P46094 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XCR1P46094 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XCR1P46094 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms