Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLC1A4P43007 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC1A4P43007 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC1A4P43007 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC1A4P43007 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLC1A4P43007 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC1A4P43007 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC1A4P43007 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC1A4P43007 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC1A4P43007 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms