Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 PAU19YMR325W 375 nt9.64□□□□□ -0.87
VID28P40547 AGP3YFL055W 1677 nt9.64□□□□□ -0.87
VID28P40547 FRE6YLL051C 2139 nt9.64□□□□□ -0.87
VID28P40547 THI3YDL080C 1830 nt9.63□□□□□ -0.87
VID28P40547 IPL1YPL209C 1104 nt9.63□□□□□ -0.87
VID28P40547 VBA3YCL069W 1377 nt9.63□□□□□ -0.87
VID28P40547 FLX1YIL134W 936 nt9.62□□□□□ -0.87
VID28P40547 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.6□□□□□ -0.87
VID28P40547 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.6□□□□□ -0.87
VID28P40547 SBP1YHL034C 885 nt9.6□□□□□ -0.87
VID28P40547 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.59□□□□□ -0.87
VID28P40547 YDR467CYDR467C 327 nt9.57□□□□□ -0.88
VID28P40547 MOB1YIL106W 945 nt9.57□□□□□ -0.88
VID28P40547 GPM1YKL152C 744 nt9.57□□□□□ -0.88
VID28P40547 CYT1YOR065W 930 nt9.57□□□□□ -0.88
VID28P40547 GAS1YMR307W 1680 nt9.56□□□□□ -0.88
VID28P40547 PTC6YCR079W 1329 nt9.56□□□□□ -0.88
VID28P40547 NPP2YEL016C 1482 nt9.55□□□□□ -0.88
VID28P40547 GGA2YHR108W 1758 nt9.55□□□□□ -0.88
VID28P40547 SLG1YOR008C 1137 nt9.54□□□□□ -0.88
VID28P40547 URA8YJR103W 1737 nt9.53□□□□□ -0.88
VID28P40547 INH1YDL181W 258 nt9.52□□□□□ -0.89
VID28P40547 YPT11YNL304W 1254 nt9.52□□□□□ -0.89
VID28P40547 YFR020WYFR020W 699 nt9.5□□□□□ -0.89
VID28P40547 ENO1YGR254W 1314 nt9.5□□□□□ -0.89
VID28P40547 YHL008CYHL008C 1884 nt9.49□□□□□ -0.89
VID28P40547 YCR025CYCR025C 411 nt9.48□□□□□ -0.89
VID28P40547 YBL095WYBL095W 813 nt9.48□□□□□ -0.89
VID28P40547 LYS20YDL182W 1287 nt9.47□□□□□ -0.89
VID28P40547 CYC3YAL039C 810 nt9.47□□□□□ -0.89
VID28P40547 FET5YFL041W 1869 nt9.46□□□□□ -0.9
VID28P40547 SRP102YKL154W 735 nt9.45□□□□□ -0.9
VID28P40547 GID7YCL039W 2238 nt9.45□□□□□ -0.9
VID28P40547 SER2YGR208W 930 nt9.44□□□□□ -0.9
VID28P40547 YLR280CYLR280C 351 nt9.44□□□□□ -0.9
VID28P40547 AAC3YBR085W 924 nt9.44□□□□□ -0.9
VID28P40547 ERO1YML130C 1692 nt9.42□□□□□ -0.9
VID28P40547 SWM1YDR260C 513 nt9.41□□□□□ -0.9
VID28P40547 RIB1YBL033C 1038 nt9.41□□□□□ -0.9
VID28P40547 MTO1YGL236C 2010 nt9.41□□□□□ -0.9
VID28P40547 YMC2YBR104W 990 nt9.4□□□□□ -0.9
VID28P40547 AAT1YKL106W 1356 nt9.39□□□□□ -0.91
VID28P40547 NBA1YOL070C 1506 nt9.39□□□□□ -0.91
VID28P40547 YLR072WYLR072W 2082 nt9.38□□□□□ -0.91
VID28P40547 RSM7YJR113C 744 nt9.38□□□□□ -0.91
VID28P40547 TMS1YDR105C 1422 nt9.38□□□□□ -0.91
VID28P40547 SAM50YNL026W 1455 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 HTS1YPR033C 1641 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 YGR210CYGR210C 1236 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 YIA6YIL006W 1122 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 MRS4YKR052C 915 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 TRP2YER090W 1524 nt9.36□□□□□ -0.91
VID28P40547 TPN1YGL186C 1740 nt9.34□□□□□ -0.91
VID28P40547 YCP4YCR004C 744 nt9.34□□□□□ -0.91
VID28P40547 SOD2YHR008C 702 nt9.34□□□□□ -0.91
VID28P40547 THI6YPL214C 1623 nt9.34□□□□□ -0.91
VID28P40547 ERG6YML008C 1152 nt9.33□□□□□ -0.92
VID28P40547 RNA170RNA170 169 nt9.33□□□□□ -0.92
VID28P40547 YRF1-2YER190W 5046 nt9.33□□□□□ -0.92
VID28P40547 HXT11YOL156W 1704 nt9.33□□□□□ -0.92
VID28P40547 HXK1YFR053C 1458 nt9.33□□□□□ -0.92
VID28P40547 YBR056WYBR056W 1506 nt9.31□□□□□ -0.92
VID28P40547 snR86snR86 1004 nt9.31□□□□□ -0.92
VID28P40547 MET22YOL064C 1074 nt9.31□□□□□ -0.92
VID28P40547 ALD5YER073W 1563 nt9.31□□□□□ -0.92
VID28P40547 YPL108WYPL108W 507 nt9.3□□□□□ -0.92
VID28P40547 YJR149WYJR149W 1215 nt9.28□□□□□ -0.92
VID28P40547 EMC3YKL207W 762 nt9.28□□□□□ -0.92
VID28P40547 YIR035CYIR035C 765 nt9.27□□□□□ -0.93
VID28P40547 YMR166CYMR166C 1107 nt9.27□□□□□ -0.93
VID28P40547 MEP1YGR121C 1479 nt9.27□□□□□ -0.93
VID28P40547 SRM1YGL097W 1449 nt9.26□□□□□ -0.93
VID28P40547 OCH1YGL038C 1443 nt9.25□□□□□ -0.93
VID28P40547 PDC6YGR087C 1692 nt9.25□□□□□ -0.93
VID28P40547 CAK1YFL029C 1107 nt9.24□□□□□ -0.93
VID28P40547 YLR460CYLR460C 1131 nt9.24□□□□□ -0.93
VID28P40547 BUB2YMR055C 921 nt9.24□□□□□ -0.93
VID28P40547 FCY1YPR062W 477 nt9.24□□□□□ -0.93
VID28P40547 ABP1YCR088W 1779 nt9.23□□□□□ -0.93
VID28P40547 YJL009WYJL009W 327 nt9.23□□□□□ -0.93
VID28P40547 LSP1YPL004C 1026 nt9.23□□□□□ -0.93
VID28P40547 PET18YCR020C 648 nt9.22□□□□□ -0.93
VID28P40547 CHS7YHR142W 951 nt9.22□□□□□ -0.93
VID28P40547 YJL160CYJL160C 864 nt9.21□□□□□ -0.94
VID28P40547 GTB1YDR221W 2109 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.2□□□□□ -0.94
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