Protein–RNA interactions for Protein: P40073

SHO1, High osmolarity signaling protein SHO1, yeastyeast

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1P40073 SNX3YOR357C 489 nt7.52□□□□□ -1.21
SHO1P40073 SSL2YIL143C 2532 nt7.52□□□□□ -1.21
SHO1P40073 RSC4YKR008W 1878 nt7.51□□□□□ -1.21
SHO1P40073 HXK1YFR053C 1458 nt7.51□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YCR025CYCR025C 411 nt7.5□□□□□ -1.21
SHO1P40073 ADH3YMR083W 1128 nt7.5□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YCP4YCR004C 744 nt7.49□□□□□ -1.21
SHO1P40073 CRC1YOR100C 984 nt7.49□□□□□ -1.21
SHO1P40073 MTO1YGL236C 2010 nt7.49□□□□□ -1.21
SHO1P40073 SDS24YBR214W 1584 nt7.48□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YMR209CYMR209C 1374 nt7.47□□□□□ -1.21
SHO1P40073 CYC3YAL039C 810 nt7.47□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YKL053WYKL053W 375 nt7.47□□□□□ -1.21
SHO1P40073 YKR012CYKR012C 378 nt7.47□□□□□ -1.21
SHO1P40073 REX2YLR059C 810 nt7.47□□□□□ -1.21
SHO1P40073 MOB1YIL106W 945 nt7.46□□□□□ -1.22
SHO1P40073 ALD5YER073W 1563 nt7.46□□□□□ -1.22
SHO1P40073 SAN1YDR143C 1833 nt7.45□□□□□ -1.22
SHO1P40073 SRP54YPR088C 1626 nt7.45□□□□□ -1.22
SHO1P40073 VBA3YCL069W 1377 nt7.45□□□□□ -1.22
SHO1P40073 YDR306CYDR306C 1437 nt7.44□□□□□ -1.22
SHO1P40073 ODC1YPL134C 933 nt7.44□□□□□ -1.22
SHO1P40073 ENO1YGR254W 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
SHO1P40073 TOM71YHR117W 1920 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 SWM1YDR260C 513 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 SRP102YKL154W 735 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 RPC31YNL151C 756 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 YPT11YNL304W 1254 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 ALR1YOL130W 2580 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 SAM50YNL026W 1455 nt7.43□□□□□ -1.22
SHO1P40073 SER2YGR208W 930 nt7.42□□□□□ -1.22
SHO1P40073 RIM2YBR192W 1134 nt7.42□□□□□ -1.22
SHO1P40073 KGD2YDR148C 1392 nt7.42□□□□□ -1.22
SHO1P40073 LYS20YDL182W 1287 nt7.4□□□□□ -1.22
SHO1P40073 YIA6YIL006W 1122 nt7.4□□□□□ -1.22
SHO1P40073 MDM35YKL053C-A 261 nt7.4□□□□□ -1.22
SHO1P40073 TPN1YGL186C 1740 nt7.4□□□□□ -1.23
SHO1P40073 DPL1YDR294C 1770 nt7.4□□□□□ -1.23
SHO1P40073 HTS1YPR033C 1641 nt7.39□□□□□ -1.23
SHO1P40073 SBP1YHL034C 885 nt7.39□□□□□ -1.23
SHO1P40073 Q0010Q0010 387 nt7.39□□□□□ -1.23
SHO1P40073 YFR020WYFR020W 699 nt7.38□□□□□ -1.23
SHO1P40073 RIB1YBL033C 1038 nt7.38□□□□□ -1.23
SHO1P40073 DMA2YNL116W 1569 nt7.37□□□□□ -1.23
SHO1P40073 GAS1YMR307W 1680 nt7.36□□□□□ -1.23
SHO1P40073 YLR280CYLR280C 351 nt7.36□□□□□ -1.23
SHO1P40073 ERO1YML130C 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
SHO1P40073 YIL177CYIL177C 5277 nt7.35□□□□□ -1.23
SHO1P40073 YMR007WYMR007W 381 nt7.35□□□□□ -1.23
SHO1P40073 NSG2YNL156C 900 nt7.35□□□□□ -1.23
SHO1P40073 YLR173WYLR173W 1827 nt7.34□□□□□ -1.24
SHO1P40073 PUS7YOR243C 2031 nt7.34□□□□□ -1.24
SHO1P40073 YGR210CYGR210C 1236 nt7.33□□□□□ -1.24
SHO1P40073 RSM7YJR113C 744 nt7.33□□□□□ -1.24
SHO1P40073 PSD1YNL169C 1503 nt7.32□□□□□ -1.24
SHO1P40073 PTC6YCR079W 1329 nt7.32□□□□□ -1.24
SHO1P40073 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.32□□□□□ -1.24
SHO1P40073 GGA2YHR108W 1758 nt7.31□□□□□ -1.24
SHO1P40073 RCR1YBR005W 642 nt7.31□□□□□ -1.24
SHO1P40073 SOD2YHR008C 702 nt7.3□□□□□ -1.24
SHO1P40073 YJR154WYJR154W 1041 nt7.3□□□□□ -1.24
SHO1P40073 CYT1YOR065W 930 nt7.3□□□□□ -1.24
SHO1P40073 DUR3YHL016C 2208 nt7.29□□□□□ -1.24
SHO1P40073 THI3YDL080C 1830 nt7.29□□□□□ -1.24
SHO1P40073 GPM1YKL152C 744 nt7.28□□□□□ -1.24
SHO1P40073 ERG6YML008C 1152 nt7.28□□□□□ -1.24
SHO1P40073 YPL108WYPL108W 507 nt7.28□□□□□ -1.24
SHO1P40073 YHR218WYHR218W 1812 nt7.28□□□□□ -1.24
SHO1P40073 LEU4YNL104C 1860 nt7.28□□□□□ -1.24
SHO1P40073 INH1YDL181W 258 nt7.27□□□□□ -1.25
SHO1P40073 RTG2YGL252C 1767 nt7.26□□□□□ -1.25
SHO1P40073 MDL2YPL270W 2322 nt7.26□□□□□ -1.25
SHO1P40073 YDR467CYDR467C 327 nt7.26□□□□□ -1.25
SHO1P40073 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.25□□□□□ -1.25
SHO1P40073 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.25□□□□□ -1.25
SHO1P40073 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.25□□□□□ -1.25
SHO1P40073 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.25□□□□□ -1.25
SHO1P40073 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.25□□□□□ -1.25
SHO1P40073 HXT10YFL011W 1641 nt7.24□□□□□ -1.25
SHO1P40073 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SHO1P40073 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SHO1P40073 YLR460CYLR460C 1131 nt7.24□□□□□ -1.25
SHO1P40073 YMR166CYMR166C 1107 nt7.24□□□□□ -1.25
SHO1P40073 GNP1YDR508C 1992 nt7.23□□□□□ -1.25
SHO1P40073 MET8YBR213W 825 nt7.23□□□□□ -1.25
SHO1P40073 YIR035CYIR035C 765 nt7.22□□□□□ -1.25
SHO1P40073 AAC3YBR085W 924 nt7.22□□□□□ -1.25
SHO1P40073 THI6YPL214C 1623 nt7.22□□□□□ -1.25
SHO1P40073 POP2YNR052C 1302 nt7.22□□□□□ -1.25
SHO1P40073 CHS7YHR142W 951 nt7.21□□□□□ -1.26
SHO1P40073 YJL160CYJL160C 864 nt7.21□□□□□ -1.26
SHO1P40073 YBL095WYBL095W 813 nt7.21□□□□□ -1.26
SHO1P40073 AGP3YFL055W 1677 nt7.21□□□□□ -1.26
SHO1P40073 TMS1YDR105C 1422 nt7.2□□□□□ -1.26
SHO1P40073 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.2□□□□□ -1.26
SHO1P40073 RRT14YIL127C 621 nt7.2□□□□□ -1.26
SHO1P40073 FCY1YPR062W 477 nt7.2□□□□□ -1.26
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