Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJC1P36383 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJC1P36383 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJC1P36383 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJC1P36383 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJC1P36383 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJC1P36383 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJC1P36383 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJC1P36383 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJC1P36383 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJC1P36383 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJC1P36383 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJC1P36383 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJC1P36383 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJC1P36383 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJC1P36383 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJC1P36383 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJC1P36383 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJC1P36383 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJC1P36383 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJC1P36383 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJC1P36383 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJC1P36383 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJC1P36383 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJC1P36383 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJC1P36383 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJC1P36383 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJC1P36383 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GJC1P36383 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJC1P36383 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GJC1P36383 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJC1P36383 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJC1P36383 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJC1P36383 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJC1P36383 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJC1P36383 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJC1P36383 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJC1P36383 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJC1P36383 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJC1P36383 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJC1P36383 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJC1P36383 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJC1P36383 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJC1P36383 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJC1P36383 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJC1P36383 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJC1P36383 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJC1P36383 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJC1P36383 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GJC1P36383 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJC1P36383 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJC1P36383 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJC1P36383 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJC1P36383 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJC1P36383 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJC1P36383 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJC1P36383 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJC1P36383 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJC1P36383 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJC1P36383 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJC1P36383 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJC1P36383 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJC1P36383 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJC1P36383 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJC1P36383 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJC1P36383 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJC1P36383 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJC1P36383 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJC1P36383 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJC1P36383 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJC1P36383 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJC1P36383 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJC1P36383 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJC1P36383 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJC1P36383 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJC1P36383 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJC1P36383 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJC1P36383 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJC1P36383 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJC1P36383 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJC1P36383 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJC1P36383 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJC1P36383 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJC1P36383 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJC1P36383 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJC1P36383 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJC1P36383 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJC1P36383 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJC1P36383 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJC1P36383 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJC1P36383 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJC1P36383 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJC1P36383 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJC1P36383 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJC1P36383 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJC1P36383 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJC1P36383 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJC1P36383 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJC1P36383 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJC1P36383 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms