Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THBS4P35443 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS4P35443 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS4P35443 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS4P35443 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS4P35443 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS4P35443 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS4P35443 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS4P35443 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS4P35443 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS4P35443 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS4P35443 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THBS4P35443 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THBS4P35443 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THBS4P35443 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THBS4P35443 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS4P35443 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS4P35443 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS4P35443 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS4P35443 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS4P35443 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS4P35443 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS4P35443 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS4P35443 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS4P35443 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS4P35443 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS4P35443 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS4P35443 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THBS4P35443 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS4P35443 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS4P35443 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS4P35443 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS4P35443 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS4P35443 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS4P35443 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS4P35443 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS4P35443 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS4P35443 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THBS4P35443 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THBS4P35443 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
THBS4P35443 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THBS4P35443 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
THBS4P35443 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THBS4P35443 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THBS4P35443 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THBS4P35443 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS4P35443 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS4P35443 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS4P35443 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS4P35443 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS4P35443 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS4P35443 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS4P35443 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS4P35443 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS4P35443 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS4P35443 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS4P35443 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS4P35443 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS4P35443 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS4P35443 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS4P35443 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS4P35443 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS4P35443 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS4P35443 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS4P35443 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS4P35443 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS4P35443 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS4P35443 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THBS4P35443 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS4P35443 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS4P35443 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS4P35443 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS4P35443 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS4P35443 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS4P35443 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS4P35443 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS4P35443 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS4P35443 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS4P35443 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS4P35443 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS4P35443 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS4P35443 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS4P35443 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS4P35443 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS4P35443 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
THBS4P35443 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS4P35443 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS4P35443 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms